More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0717 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0717  histidine kinase  100 
 
 		 396 aa  808    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  26.5 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  28.22 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  24.88 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  25.53 
 
 		 448 aa  96.3  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 517 aa  95.9  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 827 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 613 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 662 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  29.96 
 
 		 1161 aa  90.5  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 		 1126 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 882 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 620 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 627 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 1177 aa  87  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0642  sensor histidine kinase/response regulator  28.06 
 
 		 1385 aa  87  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  28.32 
 
 		 1055 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6950  histidine kinase  25.48 
 
 		 721 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0980  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 1171 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  28 
 
 		 935 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 645 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  28.9 
 
 		 676 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  29.13 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 680 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 944 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 		 1032 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 614 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  25.76 
 
 		 927 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 686 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 638 aa  83.2  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  28.38 
 
 		 1142 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  25 
 
 		 667 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 639 aa  83.2  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 1124 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 621 aa  82.8  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 606 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  26.13 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4132  histidine kinase  24.58 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4093  histidine kinase  24.17 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  26.49 
 
 		 918 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1128 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  25.88 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  26.42 
 
 		 1159 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  26.42 
 
 		 1159 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  27.27 
 
 		 742 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.63 
 
 		 1158 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 721 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 895 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 		 1146 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 		 1146 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  27.85 
 
 		 1128 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  26.56 
 
 		 1125 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  28.69 
 
 		 1068 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 885 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  28.91 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.91 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.91 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.91 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.91 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 928 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  26.52 
 
 		 918 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  28.91 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.23 
 
 		 1146 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.91 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.91 
 
 		 778 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  24.1 
 
 		 1145 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  27.39 
 
 		 1157 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 641 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 673 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 530 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.11 
 
 		 936 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 634 aa  79.3  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  28.57 
 
 		 936 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  26.94 
 
 		 1100 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 606 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 1138 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0957  Signal transduction histidine kinase  22.37 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  24.67 
 
 		 847 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  28.7 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  30 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 713 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.363366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 1197 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.95 
 
 		 857 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  27.48 
 
 		 1147 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5358  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 891 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  25.93 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1853 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 932 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>