270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1173 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 
244 aa  471  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  89.34 
 
 
300 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  86.07 
 
 
255 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.83 
 
 
281 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  38.33 
 
 
250 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  38.11 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.5 
 
 
247 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  37.55 
 
 
254 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  36.18 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  32.41 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  34.17 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  34.65 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.08 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  34.98 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  35.74 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  36.18 
 
 
255 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.27 
 
 
259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  34.75 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  34.01 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  34.55 
 
 
263 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  32.79 
 
 
259 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  35.42 
 
 
248 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  31.85 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  32.26 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  35.25 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  35.63 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.25 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  33.06 
 
 
253 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  30.58 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  30.99 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  39.27 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  35.56 
 
 
255 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  33.73 
 
 
270 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  35.77 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.39 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.67 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  34.02 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  31.54 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  33.47 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1801  peptidase A24A domain-containing protein  35.43 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  32.8 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  32.8 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  32.67 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  32.54 
 
 
274 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  34.15 
 
 
251 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  31.45 
 
 
264 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  33.33 
 
 
288 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  27.69 
 
 
304 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.02 
 
 
273 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  27.2 
 
 
308 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.6 
 
 
288 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  32.97 
 
 
304 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  27.2 
 
 
308 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  26.78 
 
 
304 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0538  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  34.87 
 
 
250 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  33.61 
 
 
240 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  32.14 
 
 
261 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.84 
 
 
293 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  29.26 
 
 
283 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0970  prepilin peptidase  32.95 
 
 
273 aa  101  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  33.19 
 
 
240 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  27.78 
 
 
303 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  26.5 
 
 
303 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  29.39 
 
 
283 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  28.89 
 
 
288 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  33.86 
 
 
278 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0682  peptidase A24A domain-containing protein  31.7 
 
 
290 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.301277  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1879  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 
258 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.240365  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  30 
 
 
291 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  29.41 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  28.89 
 
 
288 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  25.97 
 
 
308 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  28.89 
 
 
294 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  36.36 
 
 
262 aa  99  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  28.57 
 
 
289 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  27.82 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  33.77 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  30.14 
 
 
288 aa  95.9  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  32.35 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  33.06 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  29.11 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  33.06 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  29.92 
 
 
280 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  35.25 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.27 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.63 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  31.09 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  27.39 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  31.2 
 
 
286 aa  92.8  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  29.45 
 
 
320 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  30.45 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  31.2 
 
 
286 aa  92  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1561  peptidase A24A domain protein  31.74 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.39 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0548  peptidase A24A domain-containing protein  32.47 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  29.58 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  26.61 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  29.46 
 
 
299 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  26.52 
 
 
289 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.14 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>