183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1505 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  67.75 
 
 		 464 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 467 aa  962    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  65 
 
 		 490 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.95 
 
 		 458 aa  538  9.999999999999999e-153  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.13 
 
 		 465 aa  521  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.6 
 
 		 481 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.94 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.57 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.13 
 
 		 473 aa  481  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.47 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.13 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  50 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  50 
 
 		 491 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.89 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.3 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.82 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.6 
 
 		 479 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.4 
 
 		 477 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.6 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  49.47 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.91 
 
 		 458 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.43 
 
 		 489 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.68 
 
 		 468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.28 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.14 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.92 
 
 		 487 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  44.12 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.45 
 
 		 473 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.38 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.51 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.89 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  44.64 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.71 
 
 		 472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.3 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.72 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.21 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  39 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.61 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.89 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.52 
 
 		 370 aa  206  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.04 
 
 		 370 aa  206  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.05 
 
 		 369 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.15 
 
 		 371 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.81 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.93 
 
 		 374 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.69 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.51 
 
 		 371 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.83 
 
 		 371 aa  203  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.12 
 
 		 371 aa  203  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.81 
 
 		 371 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.4 
 
 		 376 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.4 
 
 		 376 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.03 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.43 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.54 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.24 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.22 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.08 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.48 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.22 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.97 
 
 		 371 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.53 
 
 		 370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.66 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.13 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.94 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.83 
 
 		 375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 		 368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.27 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.29 
 
 		 377 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.29 
 
 		 377 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.74 
 
 		 372 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.29 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.29 
 
 		 377 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.44 
 
 		 370 aa  196  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  32 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  33.24 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.08 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.29 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.54 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.705115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.37 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.37 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.71 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.14 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.37 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.29 
 
 		 377 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.57 
 
 		 376 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  32.79 
 
 		 371 aa  193  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.3 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.36 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.36 
 
 		 377 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  31.79 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.43 
 
 		 377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.58 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.13 
 
 		 354 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.01 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.15 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.79 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.32 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.05 
 
 		 368 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.98 
 
 		 385 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>