61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1862 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 71 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  78.79 
 
 		 84 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  76.12 
 
 		 69 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  80 
 
 		 74 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  70.49 
 
 		 83 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  67.69 
 
 		 65 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  69.49 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  66.13 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  67.24 
 
 		 64 aa  93.6  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  62.69 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1226  DNA binding domain-containing protein  59.02 
 
 		 75 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0533  DNA binding domain, excisionase family  43.1 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  43.48 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  33.93 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  34.29 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  34.29 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  28.12 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  30.36 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  30.36 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  29.17 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  29.17 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  34.62 
 
 		 676 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  39.22 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  30.36 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  28.38 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  28.38 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  31.88 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  31.67 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  33.33 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  37.93 
 
 		 290 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0369  DNA binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000403691  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  26.79 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  31.91 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  31.48 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3283  hypothetical protein  29.23 
 
 		 121 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 67 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2264  DNA binding domain protein, excisionase family  32.81 
 
 		 328 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  26.92 
 
 		 56 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2798  DNA binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  30.19 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  30 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  29.41 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  31.37 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  36 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_002620  TC0563  PTS system, IIA component  25.4 
 
 		 223 aa  40.8  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.11237  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03950  hypothetical protein  30.43 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  32.08 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0680  DNA binding domain protein, excisionase family  26.87 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  38.18 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 293 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>