271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0097 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  716    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  53.8 
 
 
359 aa  363  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  49.85 
 
 
360 aa  295  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  46.87 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  41.67 
 
 
395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  24.46 
 
 
708 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  31.98 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  31.14 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  27.78 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  31.46 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  31.93 
 
 
727 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  32.62 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  32.14 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  32.14 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  29.29 
 
 
664 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  27.22 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.02 
 
 
697 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.43 
 
 
664 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  31.95 
 
 
729 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  26.02 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.6 
 
 
746 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  25.88 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  28.65 
 
 
691 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  27.37 
 
 
659 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  29.79 
 
 
728 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  28.14 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  30.43 
 
 
730 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  29.63 
 
 
731 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  27.34 
 
 
725 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  27.34 
 
 
625 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  29.63 
 
 
732 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  29.88 
 
 
731 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  29.88 
 
 
731 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.31 
 
 
670 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  25.41 
 
 
698 aa  59.7  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.04 
 
 
697 aa  59.7  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.48 
 
 
680 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  27.49 
 
 
680 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  25.32 
 
 
359 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  30.22 
 
 
725 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  20 
 
 
746 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  31.21 
 
 
676 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3878  putative transmembrane protein  30.56 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.347989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  29.29 
 
 
380 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3991  hypothetical protein  30.56 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  29.81 
 
 
725 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  25.83 
 
 
681 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  27.27 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  29.67 
 
 
725 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  25.74 
 
 
354 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  29.67 
 
 
725 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.03 
 
 
738 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.95 
 
 
653 aa  55.8  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  25.53 
 
 
734 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  30.38 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  30.38 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.95 
 
 
734 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  30.38 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  29.93 
 
 
733 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.38 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.11 
 
 
702 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  30.38 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  26.71 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  30.38 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  30.38 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  30.38 
 
 
733 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  25.97 
 
 
744 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  26.34 
 
 
725 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.43 
 
 
719 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  27.97 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  24.2 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  29.3 
 
 
682 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  25.15 
 
 
726 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  30.3 
 
 
690 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  24.2 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.03 
 
 
738 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  24.2 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  29.2 
 
 
734 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  27.38 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.28 
 
 
655 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  29.2 
 
 
734 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  23.28 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.28 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  24.2 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.28 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.28 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  24.2 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.28 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.63 
 
 
690 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.28 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  23.28 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  23.28 
 
 
655 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  26.2 
 
 
374 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  31.41 
 
 
690 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  30.63 
 
 
711 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  28.21 
 
 
639 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  22.58 
 
 
352 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  29.08 
 
 
679 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  29.71 
 
 
203 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>