More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3828 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3828  putative DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0261  putative DNA-binding transcriptional regulator  87.14 
 
 		 311 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3670  putative DNA-binding transcriptional regulator  85.67 
 
 		 314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0270  putative DNA-binding transcriptional regulator  84.98 
 
 		 314 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4393  putative DNA-binding transcriptional regulator  83.83 
 
 		 303 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3680  putative DNA-binding transcriptional regulator  81.52 
 
 		 308 aa  524  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0418  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.53 
 
 		 303 aa  521  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03103  predicted DNA-binding transcriptional regulator, efflux system  81.33 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0463  transcriptional regulator, LysR family  81.33 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3539  putative DNA-binding transcriptional regulator  81.33 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3432  putative DNA-binding transcriptional regulator  81.33 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4560  putative DNA-binding transcriptional regulator  81.33 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0463  putative DNA-binding transcriptional regulator  81.33 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03054  hypothetical protein  81.33 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3726  putative DNA-binding transcriptional regulator  81.33 
 
 		 309 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0482  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.87 
 
 		 303 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1178  putative DNA-binding transcriptional regulator  79.87 
 
 		 303 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237766  hitchhiker  0.000914509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3559  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.07 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3275  putative DNA-binding transcriptional regulator  81 
 
 		 309 aa  512  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3727  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.07 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107486 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3630  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.07 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.75458  normal  0.0429881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3665  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.07 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.99326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3558  putative DNA-binding transcriptional regulator  80.07 
 
 		 309 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0810  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3610  hypothetical protein  34.47 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  32.19 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3351  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  30.69 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.545822  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1670  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.969341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01500  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.621412 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2206  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000518708  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0198  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3930  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0309903  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4524  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3953  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1317  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00079533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0684  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0359  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1373  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0637  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0934  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001040  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>