More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0025 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0025  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 295 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 302 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  44.22 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  43.2 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 297 aa  224  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  42.71 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  43.2 
 
 		 297 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  40.14 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  41.16 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 306 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.8 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  43.49 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  43.49 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 296 aa  212  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1976  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1793  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2296  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 304 aa  208  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01306  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.41 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.387264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2317  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.342284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1444  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01316  hypothetical protein  37.41 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1541  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1568  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4793  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 328 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  40.41 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6790  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0476  LysR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2118  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0326  LysR substrate binding domain protein  39.46 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.457404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0654  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 307 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  40.14 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2045  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>