More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1110 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1110  response regulator receiver protein  100 
 
 		 117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3609  response regulator receiver domain-containing protein  59.48 
 
 		 122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2829  response regulator receiver protein  58.77 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2332  response regulator receiver protein  56.14 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0458  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3253  response regulator  44.64 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3466  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3403  response regulator receiver protein  45.71 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.809384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3179  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.164981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2959  two component signal transduction response regulator  37.5 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.888929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1705  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 502 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.75 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0622  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  36.21 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.9 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 544 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  38.46 
 
 		 705 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  35.9 
 
 		 705 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  37.61 
 
 		 241 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2940  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 500 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.3 
 
 		 457 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 234 aa  70.1  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  36.21 
 
 		 234 aa  70.1  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 235 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  38.05 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2721  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000310079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 456 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3178  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591737  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3111  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 458 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3079  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 480 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00177638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.46 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.13 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 286 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.93 
 
 		 265 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  33.05 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0872  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 471 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3920  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 232 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 237 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0237  response regulator receiver  33.96 
 
 		 248 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 264 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.79 
 
 		 232 aa  67  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 235 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  33.62 
 
 		 235 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  33.62 
 
 		 235 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 235 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0029  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.46 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.59486  normal  0.125276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  33.62 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.09 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  33.62 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  33.62 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  33.62 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  36.21 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0182  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.96 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.745426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0027  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  29.46 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  33.62 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  33.62 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  33.62 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  34.21 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.93 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 917 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  36.28 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.3 
 
 		 456 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>