44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1678 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1678  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 153 aa  306  9e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000143849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4000  DNA polymerase beta domain protein region  32.35 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  34.68 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  29.69 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  31.78 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  32.62 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0074  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.649799  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  29.32 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  36.45 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  29.32 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1672  DNA polymerase beta domain protein region  31.86 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  27.74 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1397  DNA polymerase beta domain protein region  35.42 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0347326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  26.61 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  32.79 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  28.46 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  30.58 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  29.36 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1600  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1105  DNA polymerase beta subunit  36.27 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4418  DNA polymerase beta subunit  28.89 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1316  nucleotidyltransferase  29.85 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1563  DNA polymerase beta domain protein region  25.69 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  26.09 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  34.29 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  31.13 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0825  DNA polymerase beta subunit  33.04 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0758  DNA polymerase beta subunit  26.47 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  25.89 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1276  DNA polymerase beta subunit  33.01 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  29.84 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  26.23 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1861  DNA polymerase beta subunit  31.9 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0763  DNA polymerase beta subunit  26.76 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.122769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  31.45 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  32.54 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1075  DNA polymerase beta subunit  32.93 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2422  DNA polymerase beta subunit  25.69 
 
 		 135 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0372  DNA polymerase beta subunit  25.25 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  26.67 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0760  DNA polymerase beta subunit  29.81 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0261005  normal  0.995846 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0428  DNA polymerase, beta-like region  28.7 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  29.31 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>