More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1234 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  49.59 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  43.78 
 
 		 254 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  41.41 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  43.2 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  42.4 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  41.7 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  41.77 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  42.63 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  39.77 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 		 265 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  38.35 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  35.41 
 
 		 238 aa  136  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  32.09 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.69 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  28.69 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  33.99 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  27.67 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  31.97 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  34.67 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  27.27 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  25.51 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  25.1 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  26.51 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1188  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.47 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  25.91 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  25.91 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  32.76 
 
 		 202 aa  62  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0225  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.62 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0603054  normal  0.555602 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  62  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  25.51 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  33.86 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0379  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.91 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0907  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  39.5 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  36.97 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  33.83 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  35.59 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0341  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.14 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  33.33 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  36.73 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  24.7 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11040  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.26 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  29.51 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1402  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.82 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  32.56 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  25.21 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  34.69 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  34.51 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  28.46 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  30.71 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  27.17 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  32.81 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  34.34 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  29.92 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  24.05 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1837  hypothetical protein  31.69 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0997579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>