141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0613 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  60 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  56 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  56 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  54.74 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  53.68 
 
 		 99 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  50.53 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  47.92 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  47.92 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2687  PadR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  45.26 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  34.72 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  42.59 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  28.87 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  29.13 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5527  PadR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5749  putative PadR-like family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 238 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  31.58 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0067  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.995572  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  28.28 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  36.71 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 372 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  29 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  29 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  29 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  29 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  29 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  29 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  30.68 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  29 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  31.08 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  32.58 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  29 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  28.74 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  31.46 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>