48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3039 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2521  hypothetical protein  40.44 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  59.32 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2906  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  48.48 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  48 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  52.27 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  38.33 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  35.38 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  30.97 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  30.97 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  40.62 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  45.31 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  45.28 
 
 		 223 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  38.98 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  38.81 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  28.26 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  33.85 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  38.71 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  35.63 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  34.38 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  27.54 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  27.54 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  36.84 
 
 		 880 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  46.67 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  29.03 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  33.85 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0214  hypothetical protein  34.65 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  38.6 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  40.3 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  31.34 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3164  prepilin-type cleavage/methylation-like  43.33 
 
 		 554 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00552698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  35.94 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  30.77 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004284  type 4 fimbrial biogenesis protein PilV  41.51 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  25 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  34.48 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  35.82 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  26.87 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  26 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  28.28 
 
 		 237 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  45.24 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1085  hypothetical protein  35.48 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0970  type IV pilin, putative  35.48 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.42279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>