More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5766 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5766  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 308 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5767  extracellular solute-binding protein  56.35 
 
 		 272 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21410  ABC transporter, substrate binding protein, family 3  53.21 
 
 		 292 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334752  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1129  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.69 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5765  extracellular solute-binding protein  51.89 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000625971 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  50.39 
 
 		 278 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.2 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1889  extracellular solute-binding protein family 3  52.32 
 
 		 268 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.15 
 
 		 280 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  45.71 
 
 		 279 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3310  extracellular solute-binding protein  38.06 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0117  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.51 
 
 		 274 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5520  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222381  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  32.03 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  31.13 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  31.13 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  30.74 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  32.02 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.26 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 271 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  28.03 
 
 		 283 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8012  extracellular solute-binding protein family 3  32.45 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  34.76 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 258 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 271 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.82 
 
 		 272 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.91 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  28.91 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.91 
 
 		 271 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  32.59 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  28.78 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  32.59 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  32.57 
 
 		 268 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.89 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  28.78 
 
 		 268 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5110  extracellular solute-binding protein family 3  33.49 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.7 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.7 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  42.62 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  31.68 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 		 255 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.87 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  30.77 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.68 
 
 		 264 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  36.42 
 
 		 260 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  33.55 
 
 		 275 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.55 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  41.73 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3707  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 341 aa  85.9  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 266 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 266 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  40.15 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  37.58 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  31.19 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  32.2 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.05 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3691  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.75 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  40.43 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4947  extracellular solute-binding protein family 3  38.57 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0229057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  32.56 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  39.72 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2069  extracellular solute-binding protein family 3  29.27 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404874  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2462  extracellular solute-binding protein family 3  29.27 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0931  extracellular solute-binding protein family 3  31.35 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4525  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>