281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5592 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5592  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
474 aa  962    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1112  Mannitol dehydrogenase domain protein  71.08 
 
 
464 aa  634  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0134  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  64.49 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0894  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  60.04 
 
 
467 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3167  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  60.95 
 
 
468 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00309741  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0498  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.51 
 
 
469 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884765 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1047  mannitol dehydrogenase family protein  58.15 
 
 
463 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0703  mannitol dehydrogenase family protein  57.51 
 
 
463 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  56.52 
 
 
470 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  55.72 
 
 
470 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0885  mannitol dehydrogenase family protein  58.15 
 
 
496 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0888  mannitol dehydrogenase family protein  58.15 
 
 
480 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0224596  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0344  mannitol dehydrogenase family protein  57.94 
 
 
463 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0643  mannitol dehydrogenase family protein  57.94 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0783605  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2478  mannitol dehydrogenase family protein  57.94 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.927953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0091  mannitol dehydrogenase family protein  57.94 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000701131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5916  mannitol dehydrogenase  57.94 
 
 
464 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2504  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.93 
 
 
464 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  0.524531 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1975  mannitol dehydrogenase-like  58.13 
 
 
464 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2585  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.13 
 
 
464 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2609  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.35 
 
 
464 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566868  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2633  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.72 
 
 
464 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1922  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.05 
 
 
463 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1812  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  53.83 
 
 
463 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2216  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  53.83 
 
 
463 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0712  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.08 
 
 
464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.466238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2129  putative D-arabinitol dehydrogenase oxidoreductase protein  57.48 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288509  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.49 
 
 
491 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1090  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.03 
 
 
476 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  42.49 
 
 
491 aa  299  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  40.9 
 
 
503 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  40.55 
 
 
491 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  38.11 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  37.86 
 
 
493 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  40.25 
 
 
491 aa  273  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  41.15 
 
 
491 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  40.05 
 
 
490 aa  267  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  34.14 
 
 
484 aa  266  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  35.89 
 
 
497 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  35.51 
 
 
497 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.47 
 
 
494 aa  257  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.28 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  38.89 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  35.44 
 
 
492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.88 
 
 
659 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  37.33 
 
 
496 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  37 
 
 
499 aa  249  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  34.93 
 
 
472 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.93 
 
 
472 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  32.96 
 
 
495 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  35.28 
 
 
493 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.1 
 
 
493 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.35 
 
 
509 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  38.21 
 
 
477 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  37.58 
 
 
492 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.92 
 
 
506 aa  246  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.21 
 
 
477 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.05 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.67 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.2 
 
 
494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  34.83 
 
 
493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.34 
 
 
505 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.23 
 
 
589 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.85 
 
 
488 aa  243  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  38.35 
 
 
506 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  38.27 
 
 
492 aa  240  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.32 
 
 
477 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.77 
 
 
492 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  37.56 
 
 
499 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  38.79 
 
 
509 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.79 
 
 
509 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.79 
 
 
509 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3764  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.36 
 
 
495 aa  236  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00857831  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  37.5 
 
 
499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  34.9 
 
 
493 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  31.36 
 
 
500 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.36 
 
 
485 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  37.06 
 
 
497 aa  233  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  36.02 
 
 
486 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  35.77 
 
 
486 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.02 
 
 
486 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  36.02 
 
 
486 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.89 
 
 
499 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  36.08 
 
 
498 aa  232  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  35.77 
 
 
486 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.14 
 
 
528 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.18 
 
 
487 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  35.77 
 
 
486 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  35.77 
 
 
486 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  35.77 
 
 
486 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.73 
 
 
493 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  37.53 
 
 
485 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  40.53 
 
 
510 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  35.35 
 
 
485 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  37.56 
 
 
470 aa  226  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.92 
 
 
486 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  37.29 
 
 
498 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  37.05 
 
 
489 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  37.05 
 
 
489 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  37.29 
 
 
489 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>