65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3405 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3405  helicase-like protein  100 
 
 		 477 aa  986    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469394  hitchhiker  0.00423925 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1829  SNF2-related protein  45.32 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1272  SNF2-related protein  45.32 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1197  hypothetical protein  44.12 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.786506  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0374  SNF2-related protein  45.32 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0427  hypothetical protein  45.32 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1209  SNF2-related protein  45.53 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.367756  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1485  hypothetical protein  45.12 
 
 		 470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  35.02 
 
 		 454 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  31.25 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  31.25 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1239  SNF2-related protein  35.17 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000294279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3055  SNF2-related protein  34.11 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000647509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0386  phage-associated helicase  33.47 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2848  SNF2-related protein  33.68 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0134701  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1183  hypothetical protein  47.83 
 
 		 295 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1477  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.41 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1096  SNF2 domain-containing protein  33.19 
 
 		 448 aa  226  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0071  SNF2 family helicase  34.29 
 
 		 513 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1415  SNF2-related protein  33.26 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1173  hypothetical protein  42.41 
 
 		 189 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00228603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  23.82 
 
 		 452 aa  97.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  20.12 
 
 		 559 aa  66.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.46 
 
 		 1110 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  29.09 
 
 		 674 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  24 
 
 		 1159 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  23.62 
 
 		 914 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  24.1 
 
 		 918 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  27.23 
 
 		 1163 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47179  predicted protein  25.37 
 
 		 902 aa  53.5  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  24.13 
 
 		 1081 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 876 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 1120 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  27.27 
 
 		 872 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 1102 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.73 
 
 		 1089 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.45 
 
 		 1082 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 1118 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  24.15 
 
 		 1284 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  26.91 
 
 		 985 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.06 
 
 		 1227 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  26.69 
 
 		 1112 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  30.36 
 
 		 663 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  21.64 
 
 		 1108 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  20.67 
 
 		 950 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.92 
 
 		 982 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.68 
 
 		 1143 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  22.12 
 
 		 1150 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.76 
 
 		 1160 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.67 
 
 		 1112 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  22.56 
 
 		 1003 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  20.99 
 
 		 1134 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  20.99 
 
 		 907 aa  44.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.02 
 
 		 1102 aa  44.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  23.06 
 
 		 1181 aa  44.3  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  29.49 
 
 		 1517 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  28.15 
 
 		 1141 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 		 1403 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  23.91 
 
 		 1084 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  25.17 
 
 		 663 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  22.66 
 
 		 1048 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  22.45 
 
 		 1154 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  23.4 
 
 		 896 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  21.81 
 
 		 1354 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  22.93 
 
 		 902 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>