More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3340 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3340  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
235 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.089044  normal  0.610665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.95 
 
 
256 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.89 
 
 
235 aa  316  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.75 
 
 
235 aa  278  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.69832  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
234 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
234 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
234 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.709816 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
234 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 
229 aa  225  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.352475  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
229 aa  225  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.09 
 
 
227 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
227 aa  218  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.222578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.11 
 
 
235 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.528532  normal  0.858497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.36 
 
 
227 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1171  SDR family dehydrogenase  57.33 
 
 
219 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.541454  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.32 
 
 
226 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.75 
 
 
226 aa  204  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
240 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
243 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.888248  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 
246 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6281  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
242 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
239 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  38.68 
 
 
264 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  38.68 
 
 
264 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  39.09 
 
 
247 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  37.86 
 
 
247 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  37.86 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
238 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5588  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
243 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.44 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
240 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.951488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2241  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.1 
 
 
245 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000319418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 
247 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  36.51 
 
 
248 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.34 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191512  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  36.69 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  35.74 
 
 
248 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0978902  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.51 
 
 
277 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.12 
 
 
245 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  34.94 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  36.91 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  35.89 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02908  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3670  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.657002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  36.63 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002996  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.39 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000487281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  35.29 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  31.65 
 
 
240 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  34.84 
 
 
248 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  36.63 
 
 
248 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  35.66 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1924  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 
238 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588945  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  35.89 
 
 
248 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  31.05 
 
 
251 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
248 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  35.29 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283409  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  35.29 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3542  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.71416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.37 
 
 
249 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  35.66 
 
 
248 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
240 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622765  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1587  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 
244 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000600536  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3977  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0505376 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1608  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
244 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000263068  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3453  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 
239 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.58 
 
 
263 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1265  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.44 
 
 
244 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000024738  normal  0.0393483 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  34.43 
 
 
248 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1294  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.44 
 
 
244 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000278688  decreased coverage  9.664719999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2174  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.44 
 
 
244 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  decreased coverage  0.0000000000000218664 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06461  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  32.76 
 
 
239 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1309  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.44 
 
 
244 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  decreased coverage  8.766760000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.44 
 
 
244 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000378223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1897  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.24 
 
 
245 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  31.33 
 
 
248 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
246 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  34.84 
 
 
248 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  34.43 
 
 
248 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  34.43 
 
 
248 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  34.43 
 
 
248 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  34.43 
 
 
248 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  35.6 
 
 
252 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  35.6 
 
 
252 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5275  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
239 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01089  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.98 
 
 
244 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000046254  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2585  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 
239 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.48 
 
 
245 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01097  hypothetical protein  34.98 
 
 
244 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000400605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
241 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3048  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  36.07 
 
 
248 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0681  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  36.07 
 
 
248 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1906  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.74 
 
 
244 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000158661  hitchhiker  0.0000072353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1214  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
244 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>