242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0348 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 420 aa  825    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  38.4 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  38.66 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  38.76 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  36.5 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  38.4 
 
 		 366 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  33.58 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  35.64 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  37.22 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  34.9 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  39.1 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  34.63 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  34.63 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  34.63 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  34.63 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  36.04 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  34.24 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  34.35 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  35.71 
 
 		 346 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  31 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  35.79 
 
 		 391 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  31.09 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  35.26 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  36.47 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  32.7 
 
 		 361 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  36.14 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  36.83 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  38.68 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  34.96 
 
 		 368 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 449 aa  147  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  32.82 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  33.65 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  35.52 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  35.52 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  33.24 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  33.77 
 
 		 344 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  32.99 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  34.72 
 
 		 378 aa  141  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  32.36 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  31.88 
 
 		 389 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  36.07 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 		 373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  32.25 
 
 		 384 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  30.63 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  31.86 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  31.86 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  34.74 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  34.24 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  27.09 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4734  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  29.76 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  38.6 
 
 		 238 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  26.74 
 
 		 383 aa  106  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  30.11 
 
 		 374 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  32.07 
 
 		 325 aa  86.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  33.7 
 
 		 324 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  30.59 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  33.72 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  43.75 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  34.97 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  33.97 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  35.47 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  32.23 
 
 		 240 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  31.75 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  36.32 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  27.67 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  34.34 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  38.61 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  39.43 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3284  HPP  37.2 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.463691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  38.52 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  44.35 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  28.65 
 
 		 184 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  38.27 
 
 		 178 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  35.8 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  40.68 
 
 		 156 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  33.1 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  38.71 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  32.64 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  38.82 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  42.28 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  41.41 
 
 		 159 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  41.41 
 
 		 159 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  39.09 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  41.6 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  39.55 
 
 		 152 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  40.62 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  31.17 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>