More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1540 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1540  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1432  DNA-binding response regulator  94.67 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 228 aa  217  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0286  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0274  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0232  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.156156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1322  DNA-binding response regulator  43.11 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.423029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_106  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0304  response regulator  40.54 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_86  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_85  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0106  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1311  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1330  DNA-binding response regulator  44.02 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1394  DNA-binding response regulator  39.21 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0316  DNA-binding response regulator  38.77 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1355  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0124  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0300  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0176  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0177  DNA-binding response regulator  37.05 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.68 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  35.81 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2179  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  36.77 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.16 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 231 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.7 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  36.44 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000321608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 245 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  34.53 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  33.33 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  35.59 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  36 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  35.29 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  35.68 
 
 		 244 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  35.29 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  34.84 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  32.44 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  34.84 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  33.93 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  34.84 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  34.33 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  32.44 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  32.44 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  32.44 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  31.08 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  32.59 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  34.84 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  35.11 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>