More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0856 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0856  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 407 aa  818    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0945492  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0774  hypothetical protein  87.71 
 
 		 407 aa  729    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.98334  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.72 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  27.78 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.61 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  25.86 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.3 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  25.28 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  25.68 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  24.91 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  40.57 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  32.81 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.82 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  26.46 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  32.7 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  34.26 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  21.49 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  21.53 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.33 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  26.45 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  23.81 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  22.77 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  27.72 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  31.11 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  31.85 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  28.01 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  24.02 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.33 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.84 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.48 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  24.04 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.37 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.26 
 
 		 856 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  25.87 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0402  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.4 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  29.25 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  35.19 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  36.19 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  36.19 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  36.19 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  36.19 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.44 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  24.54 
 
 		 857 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  28.46 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  33.07 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 392 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.33 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2610  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 395 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  23.59 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  21.22 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  40.46 
 
 		 452 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 857 aa  53.5  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  33.04 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  21.48 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  22.8 
 
 		 395 aa  53.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  30 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2433  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.4 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0865492  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  25.86 
 
 		 395 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  26.92 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  23.81 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.18 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  24.18 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  27.01 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.77 
 
 		 805 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  27.27 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.22 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  30.77 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  30.32 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  24.9 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  25.24 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  32.71 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  28.08 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0777  ABC lipoprotein efflux transporter, inner membrane subunit, LolE  28.31 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  30 
 
 		 1207 aa  51.6  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  22.33 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  26.19 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  32.71 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  25.89 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  32.41 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  34.96 
 
 		 793 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  26.44 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>