43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0359 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  80.95 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  81.39 
 
 		 231 aa  360  1e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  29.02 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  28.96 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  25.31 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  26.61 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  26.32 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  28.45 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  26.61 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  28.95 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  25.12 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  24.52 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  29.15 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  25.2 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  26.45 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  25.89 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  26.29 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  28.4 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  26.9 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  28.21 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  26.85 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  26.26 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  22.66 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  25.78 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  21.18 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  23.27 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  23.16 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1218  protein of unknown function DUF164  27.33 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0613005  hitchhiker  0.00414644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  22.7 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  23.56 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  27.18 
 
 		 239 aa  45.1  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  25.35 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  26.46 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  31.94 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  31.94 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  23.95 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  25.11 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  24.62 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  25.32 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  27.54 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  25.16 
 
 		 244 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>