More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5110 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
131 aa  263  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 
129 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 
128 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  45.24 
 
 
126 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 
124 aa  99  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 
124 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  45.38 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4201  Endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 
127 aa  93.2  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0467405  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  42.5 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 
126 aa  90.5  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 
127 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  42.98 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 
127 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 
127 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 
126 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  41.27 
 
 
128 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 
132 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 
126 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 
127 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 
124 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  38.53 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  41.24 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  43.7 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 
124 aa  87  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 
125 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 
128 aa  86.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 
127 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 
127 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  42.72 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  41.75 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  35.61 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  39.17 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  42.72 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  36.21 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  41.84 
 
 
126 aa  85.5  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1892  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 
130 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 
133 aa  83.6  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  40 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  42.61 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  35.29 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  39.5 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  37.7 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  39.66 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  40.5 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  40.78 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  32.82 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  39.18 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  38.18 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>