More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3719 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3719  response regulator receiver protein  100 
 
 		 117 aa  219  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.092296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  41.18 
 
 		 207 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  41.18 
 
 		 207 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  39.29 
 
 		 209 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.52 
 
 		 208 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4515  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 208 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  38.39 
 
 		 209 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 208 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  37.27 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  36.94 
 
 		 207 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 208 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  35.14 
 
 		 208 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2072  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.6 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 206 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  32.14 
 
 		 207 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0897  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  31.07 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  41.75 
 
 		 215 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0239  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  32.43 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  39 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1215  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  43.69 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  40.2 
 
 		 734 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 207 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  39.42 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0822  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.66788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 220 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  36.21 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  41.28 
 
 		 214 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  37 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00994  response regulator  35.09 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06172  response regulator  35.09 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  42.45 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 211 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 222 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 219 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 219 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  39 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  36 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0178  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6493  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0923194  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.86 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.58 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  39.62 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  34.75 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  37.86 
 
 		 494 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  37 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  36 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  38 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 217 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 236 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>