More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2101 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2101  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  596  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2785  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  26.6 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  24.58 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.5 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  29.32 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  29.32 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  29.32 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  29.32 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  29.32 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1497  transcriptional regulator CysB  25.19 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166035  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  28.62 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  28.5 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  28.45 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  31.02 
 
 		 330 aa  99.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  27.33 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0873  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0306  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0196114  decreased coverage  0.0000263412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0135  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0188343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3390  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15793  normal  0.26126 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  24.69 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3385  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  25.62 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  26.3 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0328  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  27.54 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  25.32 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  29.55 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  29.55 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  29.55 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  29.55 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  26.6 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4370  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  28.57 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  33.06 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.41 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1200  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.4 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0989  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0866  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  25.5 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>