More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2944 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
400 aa  765    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.34 
 
 
386 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.706116  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1330  quaternary amine ABC transporter permease  50 
 
 
384 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2785  quaternary amine ABC transporter permease  50 
 
 
384 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
384 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 
385 aa  262  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.44 
 
 
392 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0914  quaternary amine ABC transporter permease  45.33 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.664933 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.89368  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0843  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, permease protein  45.33 
 
 
385 aa  258  9e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2419  quaternary amine ABC transporter permease  45.33 
 
 
385 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
385 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.782089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3255  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, permease protein  45.05 
 
 
385 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 
383 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02060  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  45.05 
 
 
385 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02018  hypothetical protein  45.05 
 
 
385 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2265  quaternary amine ABC transporter permease  45.05 
 
 
385 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2353  inner membrane ABC transporter permease protein YehY  45.13 
 
 
377 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2510  inner membrane ABC transporter permease YehY  45.28 
 
 
389 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.579969  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2398  inner membrane ABC transporter permease YehY  45.28 
 
 
389 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2309  inner membrane ABC transporter permease protein YehY  45 
 
 
389 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2402  inner membrane ABC transporter permease YehY  44.57 
 
 
389 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120526  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0498  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  45.48 
 
 
392 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 
389 aa  236  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.27 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
392 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
392 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28982  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733868  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2384  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.47 
 
 
392 aa  232  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532854  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0215  ABC transporter, permease protein  45.73 
 
 
386 aa  229  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0224  ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
386 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
399 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.272859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.97 
 
 
398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.38 
 
 
392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889052  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2379  ABC transporter, permease protein  46.22 
 
 
406 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 
392 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0921  amine ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
406 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.73664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0238  amine ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
406 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1139  ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
386 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00529998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1579  amine ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
406 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1975  amine ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
406 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1994  amine ABC transporter, permease protein  45.79 
 
 
406 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.28 
 
 
398 aa  203  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225612  hitchhiker  0.00448624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2133  ABC transporter, permease protein  46.05 
 
 
807 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304775  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0628663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
386 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.255737  normal  0.184404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
388 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
434 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1923  glycine betaine transport system permease protein  48.22 
 
 
526 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0267  quaternary amine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  48.22 
 
 
526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
519 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417886 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
212 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0119  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  44.57 
 
 
523 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124345  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
222 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
211 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3333  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  40 
 
 
524 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000937167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
209 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
220 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7552  ABC glycinebetaine/carnitine/choline transporter, inner membrane subunit  43.27 
 
 
217 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease/glycine betaine/L-proline-binding protein  39.23 
 
 
517 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0522  glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter, permease/substrate-binding protein  39.23 
 
 
517 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.271995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1515  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  41.97 
 
 
526 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0692577  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.348533 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001529  probable inner-membrane permease  42.72 
 
 
199 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90895  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
217 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
217 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
217 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0902932  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
218 aa  146  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4576  glycine betaine/choline OpuC ABC transporter, permease protein  43.14 
 
 
217 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4250  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.14 
 
 
217 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0084  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  41.87 
 
 
528 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.689632  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2494  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.26 
 
 
216 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0804  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.63 
 
 
217 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
216 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.435209 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0914  choline ABC transporter permease and substrate binding protein  38.57 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.222381  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0243  amino acid ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 
211 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
216 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.721959  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
220 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485727  normal  0.10095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.6 
 
 
525 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.615651  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
251 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.11 
 
 
218 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1223  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  47.12 
 
 
512 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.13 
 
 
522 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0875398  normal  0.252786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3777  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  44.33 
 
 
520 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2993  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
217 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
235 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0139749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
236 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.660466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3828  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  43.81 
 
 
520 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109384  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 
217 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471991  normal  0.178829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
217 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473063  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1216  ABC transporter permease  43.23 
 
 
220 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.16 
 
 
217 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476701  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5205  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  40 
 
 
537 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.057164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.16 
 
 
217 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.334865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1686  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.78 
 
 
207 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.038351  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0746  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  42.86 
 
 
504 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
245 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0763  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  42.86 
 
 
504 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.458546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
224 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13590  ABC transporter permease  42.71 
 
 
220 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>