More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2099 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  66.34 
 
 
218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  66.34 
 
 
218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  66.34 
 
 
218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  62.25 
 
 
213 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  62.25 
 
 
213 aa  274  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  63 
 
 
217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  62.25 
 
 
213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  62.25 
 
 
213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  62.25 
 
 
213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  61.76 
 
 
213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  61.76 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  61.76 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  61.76 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  61.76 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  61.76 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  61.76 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  61.76 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  61.76 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  60.29 
 
 
212 aa  268  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  60.29 
 
 
211 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  60.29 
 
 
211 aa  265  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  62.38 
 
 
216 aa  264  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  60.8 
 
 
216 aa  264  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  58.91 
 
 
203 aa  254  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  57.92 
 
 
203 aa  250  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  56.65 
 
 
203 aa  247  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 
202 aa  230  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  53.23 
 
 
205 aa  216  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  48.51 
 
 
202 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 
204 aa  187  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 
204 aa  186  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 
206 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 
206 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 
206 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 
203 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  46.27 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 
207 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 
207 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  45.1 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 
207 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 
235 aa  177  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  46.27 
 
 
210 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  46.77 
 
 
204 aa  175  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  45.37 
 
 
210 aa  174  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  47.87 
 
 
188 aa  167  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 
238 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  43.15 
 
 
234 aa  158  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 
238 aa  158  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 
237 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 
237 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 
237 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 
209 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 
235 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 
237 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 
237 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 
237 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 
237 aa  148  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  40.5 
 
 
204 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  40.98 
 
 
205 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 
203 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.08 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3144  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 
236 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212447  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 
226 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 
199 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  41.58 
 
 
198 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  39.3 
 
 
201 aa  134  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  42.16 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40.53 
 
 
217 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  40.69 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  41.49 
 
 
200 aa  131  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  35.47 
 
 
220 aa  130  9e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  39.41 
 
 
227 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  40.1 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  37.81 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  38.59 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  37.75 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  40.29 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  40.69 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 
203 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 
196 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  42.35 
 
 
211 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  43.07 
 
 
214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  35.32 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  41.8 
 
 
203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  36.1 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  41.05 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>