144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7174 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7174  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  100 
 
 		 492 aa  1032    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04871  hypothetical protein  46.28 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1117  photolyase family protein  47.41 
 
 		 505 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.322412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2797  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.39 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1823  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  47.25 
 
 		 502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0760009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04471  hypothetical protein  45.03 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77539  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1361  photolyase family protein  46.91 
 
 		 498 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.174089  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04781  hypothetical protein  44.62 
 
 		 496 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.289419  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0423  hypothetical protein  44.78 
 
 		 496 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.27403  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15641  hypothetical protein  44.49 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.681049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0726  hypothetical protein  43.86 
 
 		 496 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2542  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.22 
 
 		 537 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2030  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.63 
 
 		 519 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0662893  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26230  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.57 
 
 		 532 aa  364  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355559  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3925  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.21 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02017  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.25 
 
 		 512 aa  302  9e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.571234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3689  hypothetical protein  34.17 
 
 		 512 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.116484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1785  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein protein  33.4 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1000  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.47 
 
 		 511 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4251  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.5 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1171  hypothetical protein  34.6 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2281  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.2 
 
 		 507 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1728  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.85 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483675  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07801  deoxyribodipyrimidine photolyase related protein  34.6 
 
 		 511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2809  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  32.03 
 
 		 512 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2999  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.38 
 
 		 513 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0009  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.85 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0599  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.48 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.315159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1204  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.26 
 
 		 520 aa  280  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1054  hypothetical protein  32.94 
 
 		 521 aa  279  8e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3318  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.33 
 
 		 497 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.420687  hitchhiker  0.00000494763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3641  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33 
 
 		 508 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0896  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.14 
 
 		 524 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4487  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.87 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5845  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.26 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3755  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.99 
 
 		 532 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0821  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.03 
 
 		 525 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.414989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3022  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.01 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0260  hypothetical protein  31.76 
 
 		 512 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2732  hypothetical protein  30.8 
 
 		 508 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3101  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.02 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1235  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.76 
 
 		 511 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00923753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01727  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.06 
 
 		 525 aa  262  8.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3526  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.94 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1608  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.67 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3982  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.4 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134489 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3804  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.44 
 
 		 508 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0524  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.62 
 
 		 521 aa  259  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5454  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.11 
 
 		 533 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2169  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.05 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4169  hypothetical protein  32.75 
 
 		 521 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0777  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.17 
 
 		 528 aa  256  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2956  hypothetical protein  32.86 
 
 		 508 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.195961 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3077  hypothetical protein  30.69 
 
 		 508 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0531  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.94 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.548466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2689  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.71 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1396  DNA photolyase  30.2 
 
 		 524 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.64137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0429  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.35 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0425  hypothetical protein  34.17 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000280647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5626  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.94 
 
 		 534 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147008  normal  0.0556848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3704  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.35 
 
 		 525 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4518  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.57 
 
 		 533 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3928  BCCT transporter  32.81 
 
 		 508 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.240048  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2394  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.19 
 
 		 522 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0441  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.59 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1250  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.06 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000733779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3929  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.63 
 
 		 531 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1551  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.66 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585368  normal  0.610204 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000795  DNA photolyase  31.13 
 
 		 514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06692  hypothetical protein  31.84 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0467  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.91 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0458  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.91 
 
 		 521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.86 
 
 		 502 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0647  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.5 
 
 		 528 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3872  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.6 
 
 		 521 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0335  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.07 
 
 		 522 aa  236  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0265  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.24 
 
 		 510 aa  233  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.319874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2055  putative alpha-deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.95 
 
 		 510 aa  229  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.527245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1806  hypothetical protein  32.18 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3490  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.63 
 
 		 505 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3270  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.84 
 
 		 494 aa  223  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3082  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.75 
 
 		 510 aa  223  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47785  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2791  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.24 
 
 		 500 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000121396  hitchhiker  0.0000216403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2497  hypothetical protein  29.17 
 
 		 569 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2939  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.56 
 
 		 496 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.56 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2968  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.56 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.278599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1265  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  40.52 
 
 		 186 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.73 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  29.53 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  29.53 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.04 
 
 		 486 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.8 
 
 		 469 aa  57  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.33 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.7 
 
 		 476 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.25 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  27.98 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  26.5 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  27.98 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.98 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>