More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7079 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 452 aa  908    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  35.48 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0127  protein of unknown function DUF214  33.89 
 
 		 452 aa  236  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  35.29 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  34.3 
 
 		 407 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  33.48 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  33.7 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  33.7 
 
 		 418 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  34.44 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  32.61 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  31.04 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  33.71 
 
 		 419 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  32.6 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  31.32 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  34.59 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  33.56 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  33.48 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  33.18 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  32.22 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  34.59 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  32.59 
 
 		 400 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.53 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  33.48 
 
 		 647 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  33.92 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  32.81 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  34.15 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  32.3 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  31.18 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  33.18 
 
 		 405 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.96 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  32.15 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  32.82 
 
 		 391 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  31.15 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  30.89 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  30.89 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  33.33 
 
 		 656 aa  209  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  30 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  34.3 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  33.86 
 
 		 658 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  34.3 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  32.07 
 
 		 647 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  30.59 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  30.99 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  31.54 
 
 		 410 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  30.89 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  31.58 
 
 		 409 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  31.19 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  30.44 
 
 		 650 aa  206  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 654 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  31.32 
 
 		 410 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  28.92 
 
 		 403 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  31.47 
 
 		 653 aa  203  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  32.79 
 
 		 656 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  32.22 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  32.02 
 
 		 648 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  31.54 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  32.02 
 
 		 648 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  31.89 
 
 		 656 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  30.06 
 
 		 715 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.9 
 
 		 644 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  33.03 
 
 		 402 aa  199  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  30.56 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 		 404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.03 
 
 		 663 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  31.83 
 
 		 654 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  31.64 
 
 		 649 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.82 
 
 		 402 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.82 
 
 		 402 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  31.14 
 
 		 667 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  30.63 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  30.92 
 
 		 682 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  30.92 
 
 		 682 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.1 
 
 		 656 aa  196  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.68 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  30.92 
 
 		 667 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.56 
 
 		 657 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  31.07 
 
 		 653 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  32.06 
 
 		 657 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33.1 
 
 		 663 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  31.4 
 
 		 412 aa  192  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  33.63 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.82 
 
 		 696 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.73 
 
 		 648 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  32.07 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  31.08 
 
 		 409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  30.58 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  31.08 
 
 		 409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  31.15 
 
 		 652 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  30.97 
 
 		 678 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.97 
 
 		 678 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 408 aa  190  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  31.87 
 
 		 657 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>