More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6499 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6499  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 440 aa  912    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03645  glutamyl-tRNA reductase  44.03 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  41.83 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3752  glutamyl-tRNA reductase  42.18 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0942  glutamyl-tRNA reductase  44.03 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2489  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0333  glutamyl-tRNA reductase  29.74 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3619  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.81 
 
 		 441 aa  179  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  29.56 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  29.31 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  26.86 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  27.98 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  27.47 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  29.56 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  25.44 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1892  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 460 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  30.49 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.83 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.13 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  27 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0934  glutamyl-tRNA reductase  29.51 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.83 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  25.54 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  27.17 
 
 		 453 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  25.54 
 
 		 436 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  25.3 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  28.13 
 
 		 432 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  27.25 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0894  glutamyl-tRNA reductase  29.31 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  28.86 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2128  glutamyl-tRNA reductase  31.9 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  26.79 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  25.87 
 
 		 431 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  25.06 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  27.98 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  25.94 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  25.94 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  27.88 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  27.01 
 
 		 464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1795  glutamyl-tRNA reductase  29.48 
 
 		 425 aa  156  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  25.72 
 
 		 424 aa  156  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  28.49 
 
 		 416 aa  156  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  27.9 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  25.45 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  27.4 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  25.19 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  28.24 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  25.48 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  25.99 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  26.45 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  25.63 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  26.02 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1426  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  28.66 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 398 aa  152  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  27.18 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 425 aa  150  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  25.84 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  25.12 
 
 		 420 aa  150  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  27.14 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  25.35 
 
 		 441 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  28.1 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  25.35 
 
 		 441 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  26.09 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  24.74 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  25.82 
 
 		 421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  23.28 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  23.98 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  25.78 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.45 
 
 		 423 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  26.8 
 
 		 446 aa  146  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  27.37 
 
 		 427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  26.36 
 
 		 422 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  26.29 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  26.36 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  26.36 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  26.29 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  26.29 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  26.29 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  26.29 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  26.29 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  26.29 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1195  glutamyl-tRNA reductase  27.06 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  24.94 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  27.33 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2088  glutamyl-tRNA reductase  29.54 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  26.09 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  25 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  25 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  24.5 
 
 		 428 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  23.45 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.93 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  26.3 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  25.78 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  25.68 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  26.46 
 
 		 420 aa  143  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  27.15 
 
 		 448 aa  142  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>