172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3935 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 534 aa  1111    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.37 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.67 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  38.03 
 
 		 523 aa  310  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  30.72 
 
 		 539 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.3 
 
 		 547 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  30.04 
 
 		 519 aa  236  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  28.45 
 
 		 598 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  37.18 
 
 		 554 aa  228  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  35.71 
 
 		 557 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.19 
 
 		 559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  35.03 
 
 		 540 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 525 aa  216  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 560 aa  216  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.86 
 
 		 625 aa  216  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  36.84 
 
 		 568 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.8 
 
 		 533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.92 
 
 		 565 aa  213  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  30.63 
 
 		 563 aa  213  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.8 
 
 		 533 aa  213  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.01 
 
 		 563 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  35.71 
 
 		 558 aa  210  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.92 
 
 		 624 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.47 
 
 		 566 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.43 
 
 		 549 aa  206  9e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  28.48 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.78 
 
 		 716 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.42 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.84 
 
 		 544 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  34.68 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  27.99 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.68 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  28.46 
 
 		 571 aa  200  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  30.71 
 
 		 811 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.74 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 535 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.29 
 
 		 672 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.9 
 
 		 599 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  29.06 
 
 		 718 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.25 
 
 		 560 aa  193  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.87 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.84 
 
 		 636 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.7 
 
 		 560 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  30.4 
 
 		 536 aa  190  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.11 
 
 		 668 aa  189  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.35 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 775 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  31.58 
 
 		 561 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.24 
 
 		 724 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  27.68 
 
 		 656 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.66 
 
 		 629 aa  188  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  29.76 
 
 		 572 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  31.96 
 
 		 661 aa  187  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.3 
 
 		 560 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  30.24 
 
 		 702 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 526 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.54 
 
 		 549 aa  183  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.6 
 
 		 730 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.17 
 
 		 637 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  26.95 
 
 		 631 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.39 
 
 		 531 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  29.02 
 
 		 614 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.88 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.79 
 
 		 670 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.95 
 
 		 654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1615  cell wall degradation protein  32.4 
 
 		 513 aa  174  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.12409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  29.36 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.39 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  28.84 
 
 		 530 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  30.88 
 
 		 537 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  35.07 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 539 aa  171  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.91 
 
 		 399 aa  171  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.25 
 
 		 662 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  31.36 
 
 		 524 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.86 
 
 		 426 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  32.59 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.41 
 
 		 433 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.7 
 
 		 432 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  25.25 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.28 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  27.52 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.74 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  27.52 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.19 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.57 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  29.11 
 
 		 576 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  26.59 
 
 		 502 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.12 
 
 		 648 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  29.07 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 646 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  32.64 
 
 		 618 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  32.64 
 
 		 618 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  32.64 
 
 		 596 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>