More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2734 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2734  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 764 aa  1566    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000030307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 779 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  22.46 
 
 		 773 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 766 aa  121  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 793 aa  119  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 267 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2187  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 752 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.97772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 273 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 760 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  26.07 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 544 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 546 aa  73.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  27.75 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 525 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.41 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 440 aa  70.5  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 259 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 506 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 258 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 530 aa  70.5  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  21.16 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  30.98 
 
 		 326 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 284 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 316 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  33.59 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 303 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 281 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  35.16 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  35.16 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.63 
 
 		 360 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 301 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  21.5 
 
 		 539 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 316 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 284 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 355 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 310 aa  63.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  30.11 
 
 		 299 aa  63.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 544 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 291 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 252 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3204  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 118 aa  62.4  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  20.08 
 
 		 775 aa  62.4  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 509 aa  62.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 331 aa  62  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  30.85 
 
 		 301 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 301 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 526 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 291 aa  62  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 276 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  30.85 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0868  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  31.37 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 1349 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  21.71 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  24.54 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  33.01 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  33.01 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>