More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2049 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 577 aa  1177    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.66 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.3 
 
 		 639 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.39 
 
 		 615 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.07 
 
 		 620 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  40.66 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.43 
 
 		 611 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  38.54 
 
 		 617 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.37 
 
 		 637 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.67 
 
 		 639 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.34 
 
 		 645 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.29 
 
 		 650 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  38.59 
 
 		 613 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.22 
 
 		 655 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  38.78 
 
 		 617 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  39.65 
 
 		 659 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  39.51 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  39.65 
 
 		 650 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.82 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  40 
 
 		 649 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  37.21 
 
 		 602 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.83 
 
 		 644 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  39.13 
 
 		 616 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.98 
 
 		 651 aa  398  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  38.78 
 
 		 617 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.87 
 
 		 638 aa  399  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.17 
 
 		 631 aa  398  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.67 
 
 		 651 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  45.67 
 
 		 627 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.18 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.18 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.36 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.82 
 
 		 652 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.82 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.82 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39 
 
 		 657 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.51 
 
 		 647 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  40.18 
 
 		 643 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.89 
 
 		 676 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  38.66 
 
 		 638 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.89 
 
 		 650 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  45.88 
 
 		 633 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  38.94 
 
 		 633 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  38.94 
 
 		 633 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  38.94 
 
 		 633 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.72 
 
 		 646 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  46.1 
 
 		 633 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.84 
 
 		 616 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2444  FtsH peptidase  38.16 
 
 		 633 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000343724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 		 616 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.68 
 
 		 657 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  39.72 
 
 		 608 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  38.94 
 
 		 633 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.87 
 
 		 640 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  39.46 
 
 		 645 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  40.67 
 
 		 693 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  38.34 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  39.39 
 
 		 646 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  38.39 
 
 		 647 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.44 
 
 		 627 aa  394  1e-108  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  38.94 
 
 		 633 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0579  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.41 
 
 		 717 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  39.93 
 
 		 647 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  37.67 
 
 		 612 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  39.89 
 
 		 649 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.71 
 
 		 616 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.86 
 
 		 657 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.24 
 
 		 621 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.6 
 
 		 663 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  38.94 
 
 		 633 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  38.22 
 
 		 644 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.22 
 
 		 647 aa  392  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  38.22 
 
 		 647 aa  392  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.89 
 
 		 654 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.73 
 
 		 617 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  39.58 
 
 		 647 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  38.22 
 
 		 647 aa  392  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  38.1 
 
 		 628 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  39.93 
 
 		 644 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  38.22 
 
 		 644 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.88 
 
 		 643 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.73 
 
 		 681 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  38.22 
 
 		 647 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.48 
 
 		 632 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.04 
 
 		 640 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  39.04 
 
 		 644 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  38.22 
 
 		 644 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  39.75 
 
 		 647 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0565  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.14 
 
 		 713 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.07 
 
 		 612 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  39.75 
 
 		 647 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  39.75 
 
 		 647 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  38.22 
 
 		 644 aa  392  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  39.04 
 
 		 647 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  42.91 
 
 		 655 aa  391  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.4 
 
 		 652 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  51.41 
 
 		 658 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  38.87 
 
 		 647 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.41 
 
 		 640 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.37 
 
 		 612 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>