More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1489 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 379 aa  773    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  56.08 
 
 		 381 aa  444  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  52.89 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  50.67 
 
 		 380 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  52.39 
 
 		 382 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  51.77 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  51.98 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  48.02 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  48.54 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  49.47 
 
 		 382 aa  363  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  47.49 
 
 		 381 aa  352  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  46.68 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  43.47 
 
 		 380 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  43.85 
 
 		 385 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  46.03 
 
 		 376 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  44.68 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  44.27 
 
 		 380 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  44.15 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  44.83 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  42.27 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  45.5 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  41.01 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  42.44 
 
 		 378 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  42.4 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  42.06 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  43.28 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  42.13 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  41.95 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  43.88 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  42.25 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  41.69 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  41.95 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  42.11 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  40.48 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  41.21 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  41.3 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  40.9 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  38.73 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  39.04 
 
 		 413 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  37.89 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  34.65 
 
 		 380 aa  232  9e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  36.22 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  34.12 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  34.29 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  36.15 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  32.18 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.51 
 
 		 412 aa  199  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  34.39 
 
 		 879 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  32.98 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.68 
 
 		 885 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  32.54 
 
 		 880 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 878 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.04 
 
 		 414 aa  183  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  33.25 
 
 		 393 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.49 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  32.9 
 
 		 896 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  31.07 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0469  aminotransferase, class V  33.07 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.14848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  32.28 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.75 
 
 		 435 aa  173  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  31.51 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  31.94 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.13 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.29 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  33.07 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  32.73 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.81 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.66 
 
 		 441 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 429 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  33.68 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.9 
 
 		 418 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.55 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  32.22 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.97 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.79 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.13 
 
 		 644 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  32.74 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.04 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.79 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  31.01 
 
 		 682 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.79 
 
 		 406 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.79 
 
 		 406 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.47 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.01 
 
 		 605 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.79 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.05 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.84 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.5 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.49 
 
 		 650 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.77 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.69 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  32.9 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 679 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  30.57 
 
 		 414 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.49 
 
 		 666 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  32.47 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.11 
 
 		 415 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  30.23 
 
 		 688 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  31.89 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.59 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>