90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0629 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0629  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.21 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.65 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.56 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  29.21 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.02 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.32 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.82 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.41 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.33 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.9 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.14 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  27.33 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.65 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.32 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.73 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.92 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.43 
 
 		 213 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.47 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.43 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.92 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.33 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.73 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.9 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.41 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  27.06 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.61 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.29 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.78 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.28 
 
 		 210 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  30.77 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  24.57 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.28 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.28 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  27.65 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  26.47 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.59 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.25 
 
 		 421 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.9 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.15 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.82 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  25.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.65 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  29.79 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2529  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  22.96 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  25.71 
 
 		 207 aa  44.7  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 		 198 aa  44.7  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.14 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.29 
 
 		 247 aa  44.7  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.43 
 
 		 221 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1968  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.92 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.49 
 
 		 194 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  23.39 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  23.39 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.13 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.04 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  23.39 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  23.39 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  23.39 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.13 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  23.39 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  23.39 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.71 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  36.73 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2264  putative GAF sensor protein  44.44 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.53 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.33 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.3 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.74 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1118  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.17 
 
 		 427 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.06 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.22 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  28.57 
 
 		 199 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  39.58 
 
 		 194 aa  42  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  25.14 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  26.74 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3521  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.5 
 
 		 426 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0664  ANTAR domain protein with unknown sensor  21.71 
 
 		 441 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.293281  normal  0.015345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.06 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.5 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2508  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.08 
 
 		 427 aa  41.2  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0995  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.71 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  23.5 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>