More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1047 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  77.35 
 
 		 618 aa  942    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  82.23 
 
 		 619 aa  974    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  78.16 
 
 		 620 aa  947    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  76.49 
 
 		 621 aa  939    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  78.16 
 
 		 618 aa  947    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  100 
 
 		 618 aa  1247    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  79.32 
 
 		 619 aa  963    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  46.55 
 
 		 636 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  45.38 
 
 		 608 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  43.76 
 
 		 610 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.27 
 
 		 671 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.37 
 
 		 725 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.25 
 
 		 664 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.83 
 
 		 701 aa  362  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  36.23 
 
 		 683 aa  361  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.25 
 
 		 668 aa  355  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.06 
 
 		 677 aa  355  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.72 
 
 		 703 aa  352  1e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.39 
 
 		 727 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  35.49 
 
 		 690 aa  347  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.31 
 
 		 711 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.87 
 
 		 721 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.75 
 
 		 717 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.41 
 
 		 717 aa  336  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.65 
 
 		 678 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.3 
 
 		 714 aa  324  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.94 
 
 		 688 aa  293  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  34.38 
 
 		 580 aa  286  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  32.07 
 
 		 669 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  30.1 
 
 		 680 aa  281  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  31.6 
 
 		 614 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  33.86 
 
 		 599 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  34.53 
 
 		 617 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  33.94 
 
 		 650 aa  267  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  31.48 
 
 		 637 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  30.7 
 
 		 660 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  32.28 
 
 		 619 aa  257  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  34.29 
 
 		 590 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  32.28 
 
 		 653 aa  252  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  34.75 
 
 		 586 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  34.94 
 
 		 588 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  30.84 
 
 		 605 aa  243  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  29.97 
 
 		 696 aa  242  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  31.04 
 
 		 705 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  28.67 
 
 		 670 aa  231  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  32.25 
 
 		 674 aa  227  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  32.2 
 
 		 612 aa  227  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  29.02 
 
 		 643 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.55 
 
 		 653 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.23 
 
 		 622 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.23 
 
 		 622 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.23 
 
 		 622 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.42 
 
 		 665 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.23 
 
 		 673 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.2 
 
 		 672 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  30.76 
 
 		 719 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  32.39 
 
 		 614 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  40.5 
 
 		 673 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  40.5 
 
 		 673 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.32 
 
 		 674 aa  210  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  30.84 
 
 		 657 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  29.83 
 
 		 699 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  30.56 
 
 		 618 aa  207  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  30.07 
 
 		 638 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  31.91 
 
 		 582 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  31.66 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  29.79 
 
 		 629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  28.18 
 
 		 594 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.71 
 
 		 600 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  31.57 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  36.68 
 
 		 372 aa  181  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  35.5 
 
 		 800 aa  181  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  31.63 
 
 		 563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  34.15 
 
 		 309 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  35.58 
 
 		 346 aa  170  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  39.58 
 
 		 654 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  33.12 
 
 		 364 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  34.36 
 
 		 356 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  35.64 
 
 		 340 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  32.29 
 
 		 364 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  33.97 
 
 		 566 aa  160  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  36.17 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  34.84 
 
 		 689 aa  157  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.19 
 
 		 616 aa  156  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  35.4 
 
 		 337 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  34.67 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  35.4 
 
 		 337 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  32.38 
 
 		 637 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  35.74 
 
 		 342 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  32.02 
 
 		 345 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  32.06 
 
 		 637 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  32.92 
 
 		 362 aa  153  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  32.61 
 
 		 362 aa  153  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  33.03 
 
 		 351 aa  153  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  31.4 
 
 		 347 aa  153  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  33.58 
 
 		 334 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.13 
 
 		 373 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  33.13 
 
 		 369 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  32.89 
 
 		 334 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  30.03 
 
 		 356 aa  151  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>