More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2476 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 313 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  57 
 
 		 300 aa  345  5e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  58.09 
 
 		 300 aa  340  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  54.55 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  51.97 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  48.08 
 
 		 311 aa  299  4e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  49.19 
 
 		 292 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  41.86 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  37.41 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  37.29 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  37.66 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  37.1 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  36.95 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  38.21 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  37.01 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  35.25 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 		 282 aa  195  9e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  35.69 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  35.37 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  34.22 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  38.83 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  38.27 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  37.92 
 
 		 296 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  35.21 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  38.2 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  36.09 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  36.3 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.5 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  34.08 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  32.02 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  29.75 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.64 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  29.75 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  29.43 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  29.75 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  29.43 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  29.43 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.32 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.5 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.11 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.11 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  30.67 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  31.02 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.42 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  29.69 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  29.69 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  31.69 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.48 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  27.48 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  39.39 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.14 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  32.17 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.13 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 306 aa  126  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.11 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  30.48 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  31.03 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  26.83 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 		 304 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  32.34 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  26.28 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.52 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  29.11 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  27.15 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  29.85 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  25.72 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  29.72 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  30.08 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  27.86 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  27.53 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  27.34 
 
 		 365 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.62 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.85 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  25.94 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  27.51 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>