More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1779 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  77.16 
 
 		 290 aa  494  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  78.32 
 
 		 288 aa  494  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  63.64 
 
 		 304 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  66.06 
 
 		 292 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  57.44 
 
 		 290 aa  362  6e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  56.25 
 
 		 328 aa  352  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  58.06 
 
 		 302 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  56.6 
 
 		 292 aa  345  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  56.99 
 
 		 298 aa  338  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  55.8 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  54.61 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  53.41 
 
 		 321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  55.24 
 
 		 298 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  54.9 
 
 		 298 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  54.9 
 
 		 298 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  54.9 
 
 		 298 aa  325  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  54.9 
 
 		 298 aa  325  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  54.9 
 
 		 298 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  55.76 
 
 		 298 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  54.9 
 
 		 298 aa  324  9e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  54.9 
 
 		 298 aa  324  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  54.9 
 
 		 298 aa  324  9e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  54.9 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  54.55 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  54.32 
 
 		 298 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  51.26 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  51.45 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  51.26 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  52.35 
 
 		 308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  52.52 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  52.16 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  50.55 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  52.16 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 328 aa  301  9e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 294 aa  301  9e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  49.08 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 330 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 334 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 330 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 330 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  48.59 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 329 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 329 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 329 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1184  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0667385  normal  0.0581993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  50 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 329 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 329 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 329 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  48.2 
 
 		 329 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  46.4 
 
 		 338 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  49.64 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  49.09 
 
 		 321 aa  288  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  46.4 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  46.4 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  46.4 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 368 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  45.42 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  45.86 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  45.86 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  47.08 
 
 		 297 aa  285  5e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 321 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0810  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 329 aa  285  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  48.24 
 
 		 326 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 287 aa  285  9e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 350 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  48.35 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.89 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  47.14 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  45.49 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  47.27 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0781  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.08 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  47.27 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  47.27 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  46.15 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0322  lipoyl synthase  46.62 
 
 		 333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  46.85 
 
 		 337 aa  282  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  47.97 
 
 		 311 aa  281  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  47.76 
 
 		 291 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  47.64 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>