115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0010 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  60.1 
 
 		 205 aa  254  8e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  59.11 
 
 		 205 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  59.41 
 
 		 205 aa  251  7e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  58.13 
 
 		 205 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  54.64 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  53.12 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  51.3 
 
 		 193 aa  204  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  51.3 
 
 		 193 aa  204  8e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  52.33 
 
 		 193 aa  204  9e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  49.74 
 
 		 193 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  49.22 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  49.48 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  51.55 
 
 		 175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  45.88 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  53.95 
 
 		 174 aa  174  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  45.36 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  46.91 
 
 		 182 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  52.9 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  46.39 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  51.32 
 
 		 174 aa  167  9e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  45.41 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  52.26 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  55.13 
 
 		 165 aa  161  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  47.13 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  50.31 
 
 		 174 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  44.6 
 
 		 169 aa  125  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  35.84 
 
 		 304 aa  119  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  33.76 
 
 		 301 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  32.41 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  44.44 
 
 		 160 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  35.98 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.59 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.59 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  43.43 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  43.43 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  35.19 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  36.11 
 
 		 122 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  39.81 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  39.39 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  35.19 
 
 		 122 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  37.82 
 
 		 120 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  34.26 
 
 		 122 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  39.66 
 
 		 121 aa  51.6  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  36.36 
 
 		 122 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  35.19 
 
 		 122 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  35.35 
 
 		 122 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  35 
 
 		 120 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  35.43 
 
 		 127 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  37.37 
 
 		 120 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  39.34 
 
 		 123 aa  49.7  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  39.6 
 
 		 122 aa  48.5  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  34.26 
 
 		 120 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  39.6 
 
 		 127 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  39.39 
 
 		 119 aa  48.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0076  50S ribosomal protein L18  36.27 
 
 		 117 aa  47.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0482673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  37.74 
 
 		 120 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00954  50S ribosomal protein L18  40.4 
 
 		 121 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.177845  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2153  ribosomal protein L18  38 
 
 		 116 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438386  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  32.41 
 
 		 122 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  35 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  32.41 
 
 		 122 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  37.37 
 
 		 122 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  37.62 
 
 		 120 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  36.63 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  41.35 
 
 		 120 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  36.63 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  40.2 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3806  50S ribosomal protein L18  40.78 
 
 		 117 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000406006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  35.19 
 
 		 120 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2308  50S ribosomal protein L18  37.62 
 
 		 117 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3985  50S ribosomal protein L18  39.6 
 
 		 117 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0808735  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 122 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  39.62 
 
 		 123 aa  45.4  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  38.18 
 
 		 123 aa  45.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  36.11 
 
 		 122 aa  45.1  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0336  50S ribosomal protein L18  38.78 
 
 		 117 aa  45.1  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000887363  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  38.78 
 
 		 113 aa  45.1  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  35.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  35.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  35.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  35.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  35.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  38.1 
 
 		 120 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  35.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  35.35 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  39.6 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0975  50S ribosomal protein L18  37 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000749489  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0186  50S ribosomal protein L18  36 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  39.6 
 
 		 120 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  39.6 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1005  50S ribosomal protein L18  37.11 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00185966  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  37.27 
 
 		 127 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0842  50S ribosomal protein L18  38 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0442  50S ribosomal protein L18  35.29 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110034  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  39.39 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001726  LSU ribosomal protein L18p (L5e)  39.05 
 
 		 117 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  39.39 
 
 		 120 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  39.39 
 
 		 124 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>