More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1378 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
122 aa  247  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
122 aa  247  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  75.41 
 
 
122 aa  190  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  73.77 
 
 
122 aa  189  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  72.95 
 
 
120 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  72.95 
 
 
120 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  74.59 
 
 
121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  68.03 
 
 
122 aa  169  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  65.57 
 
 
124 aa  167  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  66.39 
 
 
122 aa  165  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  65.55 
 
 
120 aa  164  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  67.21 
 
 
119 aa  164  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  70.69 
 
 
125 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  66.38 
 
 
118 aa  163  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  66.39 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  64.71 
 
 
120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  67.21 
 
 
120 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  64.71 
 
 
120 aa  160  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
120 aa  160  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
120 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
120 aa  160  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
120 aa  160  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
120 aa  160  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
120 aa  160  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
120 aa  160  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  69.67 
 
 
122 aa  159  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  65.57 
 
 
120 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
120 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  65.57 
 
 
120 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  68.03 
 
 
119 aa  157  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  68.03 
 
 
119 aa  157  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  63.03 
 
 
120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  65.29 
 
 
120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  63.03 
 
 
120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  62.3 
 
 
121 aa  153  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 
121 aa  150  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  60.5 
 
 
120 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  68.47 
 
 
114 aa  150  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  63.71 
 
 
127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  62.93 
 
 
122 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  59.02 
 
 
122 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
122 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  60.17 
 
 
122 aa  147  6e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  55.74 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  61.02 
 
 
122 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  65.35 
 
 
120 aa  144  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  65.66 
 
 
121 aa  144  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  58.68 
 
 
121 aa  143  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
121 aa  143  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  60.48 
 
 
124 aa  143  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
121 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  58.2 
 
 
122 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  63.93 
 
 
122 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
119 aa  141  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  58.2 
 
 
122 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
119 aa  141  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  62.3 
 
 
121 aa  141  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  62.93 
 
 
121 aa  140  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  60.66 
 
 
120 aa  140  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 
122 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 
122 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
120 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  65.66 
 
 
121 aa  140  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 
118 aa  140  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  58.62 
 
 
119 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  61.48 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  58.2 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  59.02 
 
 
119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  68.69 
 
 
123 aa  137  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  64.86 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  52.46 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  56.45 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  61.26 
 
 
120 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  55.74 
 
 
122 aa  137  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  65.69 
 
 
121 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  57.26 
 
 
136 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  65.57 
 
 
122 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  57.26 
 
 
122 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 
122 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  66.67 
 
 
113 aa  135  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  63.37 
 
 
121 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  57.14 
 
 
128 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  59.66 
 
 
115 aa  134  5e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  55 
 
 
123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  59.48 
 
 
124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  60.17 
 
 
122 aa  133  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  57.38 
 
 
118 aa  133  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  58.62 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  59.66 
 
 
119 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  65.14 
 
 
128 aa  130  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 
116 aa  130  5e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  61.76 
 
 
120 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  65.66 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>