More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0947 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  100 
 
 		 127 aa  243  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  73.02 
 
 		 123 aa  167  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  70.09 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  72.22 
 
 		 123 aa  163  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  66.14 
 
 		 127 aa  163  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  68.5 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  71.67 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  66.93 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  72.22 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  67.72 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  64.57 
 
 		 127 aa  151  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  65.62 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  63.78 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  63.93 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2643  ribosomal protein L18  78.22 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  62.99 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  62.4 
 
 		 124 aa  146  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  58.87 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  68.87 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  63.25 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  61.42 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  60.68 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  66.41 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  64.15 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  62.04 
 
 		 126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  60.38 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  64.65 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  62.14 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  62.14 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  62.14 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  59.09 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  60.68 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  57.52 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  56.14 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  61.39 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  60.55 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 		 122 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 122 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  60.55 
 
 		 118 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  55.88 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  53.91 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  57.66 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  59.8 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  55.96 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.85 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  56.44 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4299  ribosomal protein L18  69 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51112  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  56.88 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3907  ribosomal protein L18  67 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  53.1 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  56.07 
 
 		 121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  52.99 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  53.7 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  50.46 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  49.56 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  54.63 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  50.88 
 
 		 115 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  57.84 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>