47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2430 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  81.87 
 
 
182 aa  306  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  81.87 
 
 
182 aa  306  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  77.3 
 
 
186 aa  293  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  76.92 
 
 
187 aa  288  3e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  48.63 
 
 
174 aa  175  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  52.63 
 
 
175 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  47.89 
 
 
193 aa  169  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  47.22 
 
 
173 aa  168  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  45.92 
 
 
205 aa  167  6e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  45.92 
 
 
205 aa  167  7e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  44.39 
 
 
205 aa  166  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  44.9 
 
 
205 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  51.3 
 
 
175 aa  166  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  47.37 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  45.41 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  47.37 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  46.32 
 
 
193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  44.04 
 
 
196 aa  162  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  45.4 
 
 
174 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  44.26 
 
 
175 aa  158  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  43.52 
 
 
196 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  43.46 
 
 
194 aa  149  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  47.65 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  42.71 
 
 
195 aa  143  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  45.81 
 
 
174 aa  141  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  49.67 
 
 
169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  36.05 
 
 
160 aa  101  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  32.62 
 
 
305 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  32.7 
 
 
297 aa  92.8  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  30.13 
 
 
301 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  29.54 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  29.54 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  31.19 
 
 
304 aa  78.2  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  30 
 
 
122 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  33.33 
 
 
122 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  30.36 
 
 
122 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  38.98 
 
 
123 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  32.99 
 
 
120 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  30.36 
 
 
122 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  33.65 
 
 
120 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  38.78 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  29.17 
 
 
122 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  30.36 
 
 
122 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  33.33 
 
 
119 aa  41.6  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  35.54 
 
 
120 aa  41.2  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  34.74 
 
 
120 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>