34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_51384 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
300 aa  611  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
300 aa  611  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  56.9 
 
 
304 aa  311  6.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  51.86 
 
 
301 aa  292  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  51.36 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  47.6 
 
 
297 aa  257  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  35.59 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  36.86 
 
 
196 aa  126  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  34.73 
 
 
205 aa  124  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  34.89 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  34.89 
 
 
205 aa  119  6e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  32.63 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  33.76 
 
 
194 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  34.19 
 
 
193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  34.19 
 
 
193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  42.68 
 
 
175 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  41.48 
 
 
174 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  32.22 
 
 
195 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  33.9 
 
 
196 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  33.91 
 
 
193 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  33.19 
 
 
182 aa  109  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  32.91 
 
 
193 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  38.58 
 
 
175 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  39.46 
 
 
174 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  40.24 
 
 
175 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  33.19 
 
 
182 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  33.33 
 
 
187 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  35.51 
 
 
173 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  31.91 
 
 
186 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  33.64 
 
 
174 aa  95.9  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  31.36 
 
 
185 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  36.26 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  34.84 
 
 
169 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  27.65 
 
 
160 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>