60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2006 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  78.54 
 
 		 205 aa  343  8e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  80 
 
 		 205 aa  342  2e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  78.54 
 
 		 205 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  59.41 
 
 		 207 aa  251  6e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  59.07 
 
 		 196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  58.25 
 
 		 196 aa  215  4e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  52.88 
 
 		 193 aa  208  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  52.88 
 
 		 193 aa  208  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  52.33 
 
 		 195 aa  208  5e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  53.93 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  51.83 
 
 		 193 aa  204  7e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  52.88 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  51.83 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  61.84 
 
 		 175 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  52.36 
 
 		 182 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  51.83 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  57.14 
 
 		 174 aa  180  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  57.24 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  49.74 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  55.06 
 
 		 165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  55.92 
 
 		 175 aa  168  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  45.92 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  47.12 
 
 		 174 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  50.99 
 
 		 173 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  49.4 
 
 		 174 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  48.23 
 
 		 169 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  35 
 
 		 304 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  32.65 
 
 		 305 aa  116  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  35.21 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  31.54 
 
 		 301 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  43.36 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.73 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.73 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  32.31 
 
 		 123 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  35.29 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  31.54 
 
 		 123 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  33.33 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  33.65 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  30.36 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  33 
 
 		 116 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  33.65 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  36.27 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  30.4 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  34.17 
 
 		 122 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  35.34 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  34.65 
 
 		 123 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0335  50S ribosomal protein L18  31.15 
 
 		 118 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304847  unclonable  0.0000000454999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  34.31 
 
 		 122 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2643  ribosomal protein L18  36.27 
 
 		 123 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  33.66 
 
 		 127 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3494  50S ribosomal protein L18  34.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.463785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3788  50S ribosomal protein L18  34.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3730  50S ribosomal protein L18  34.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000891962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1940  50S ribosomal protein L18  34.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3153  50S ribosomal protein L18  34.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0233073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3052  50S ribosomal protein L18  34.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00599217  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3760  50S ribosomal protein L18  34.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00916301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2616  50S ribosomal protein L18  34.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  32.73 
 
 		 120 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>