116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0229 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  96.7 
 
 
182 aa  361  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  82.42 
 
 
186 aa  312  9.999999999999999e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  81.87 
 
 
185 aa  306  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  80.22 
 
 
187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  51.93 
 
 
173 aa  189  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  49.22 
 
 
205 aa  190  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  52.36 
 
 
205 aa  190  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  50.78 
 
 
205 aa  189  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  49.74 
 
 
205 aa  186  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  50.79 
 
 
193 aa  184  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  49.74 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  49.74 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  49.21 
 
 
193 aa  181  7e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  48.07 
 
 
174 aa  176  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  52.6 
 
 
175 aa  176  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  53.9 
 
 
174 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  45.08 
 
 
196 aa  174  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  46.91 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  53.29 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  46.88 
 
 
194 aa  167  9e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  51.32 
 
 
175 aa  164  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  44.79 
 
 
196 aa  159  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  47.13 
 
 
165 aa  152  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  42.41 
 
 
195 aa  149  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  47.1 
 
 
174 aa  148  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  45.3 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  32.89 
 
 
305 aa  104  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  38.03 
 
 
160 aa  103  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  33.65 
 
 
297 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  31.78 
 
 
301 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.93 
 
 
300 aa  99.8  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.93 
 
 
300 aa  99.8  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  32 
 
 
304 aa  88.6  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  37.5 
 
 
120 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  45.36 
 
 
120 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  33.06 
 
 
122 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  39.39 
 
 
122 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  39.39 
 
 
122 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  33.63 
 
 
122 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  38.21 
 
 
120 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  40 
 
 
120 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  41.41 
 
 
120 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  33.06 
 
 
122 aa  52  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  42.42 
 
 
120 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  41.41 
 
 
120 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  32.14 
 
 
122 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  32.14 
 
 
122 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  35.83 
 
 
120 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  41.41 
 
 
120 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  38.98 
 
 
123 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  38.38 
 
 
122 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  34.82 
 
 
122 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  32.74 
 
 
122 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  33.59 
 
 
120 aa  48.5  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  38.33 
 
 
120 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  33.06 
 
 
122 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  33.93 
 
 
120 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  32.5 
 
 
120 aa  48.5  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  38.33 
 
 
120 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  38.33 
 
 
120 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  38.33 
 
 
120 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  38.33 
 
 
120 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  32.5 
 
 
120 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  38.33 
 
 
120 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  32.79 
 
 
119 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  37.07 
 
 
124 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  37.61 
 
 
118 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  33.85 
 
 
123 aa  47.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  38.33 
 
 
120 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  38.33 
 
 
120 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  34.17 
 
 
122 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  31.97 
 
 
120 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  38.33 
 
 
120 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  34.65 
 
 
122 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  34.17 
 
 
119 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  34.17 
 
 
119 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  33.61 
 
 
120 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  36.73 
 
 
132 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  33.61 
 
 
120 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  34.43 
 
 
136 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  34.21 
 
 
127 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0617  ribosomal protein L18  34 
 
 
117 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  37.5 
 
 
120 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  35.83 
 
 
122 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  37.5 
 
 
120 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0410  50S ribosomal protein L18  31.13 
 
 
119 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0385  50S ribosomal protein L18  31.13 
 
 
119 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  38.61 
 
 
116 aa  44.3  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  36.36 
 
 
122 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  33.88 
 
 
124 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  36.73 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  30 
 
 
122 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  35.04 
 
 
120 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3508  ribosomal protein L18  35.05 
 
 
116 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000880672  hitchhiker  0.0000000983533 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  30 
 
 
122 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  34.74 
 
 
120 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  36.44 
 
 
123 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0270  50S ribosomal protein L18  34.85 
 
 
119 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0524919  normal  0.432762 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  35.64 
 
 
122 aa  42.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>