51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1868 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  87.32 
 
 		 205 aa  376  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  78.05 
 
 		 205 aa  345  3e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  78.54 
 
 		 205 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  60.1 
 
 		 207 aa  254  8e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  60.1 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  60.42 
 
 		 196 aa  227  8e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  55.73 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  54.17 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  54.17 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  53.12 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  51.31 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  54.69 
 
 		 194 aa  205  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  50.51 
 
 		 186 aa  194  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  57.89 
 
 		 175 aa  188  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  48.7 
 
 		 187 aa  188  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  49.74 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  57.14 
 
 		 174 aa  185  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  56.58 
 
 		 175 aa  184  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  49.22 
 
 		 182 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  56.33 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  45.83 
 
 		 173 aa  175  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  56.58 
 
 		 175 aa  175  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  46.35 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  48.28 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  44.9 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  50.66 
 
 		 169 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  35.17 
 
 		 304 aa  122  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  32.38 
 
 		 305 aa  114  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  34.91 
 
 		 297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  41.26 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  30.38 
 
 		 301 aa  105  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.89 
 
 		 300 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.89 
 
 		 300 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  36.97 
 
 		 127 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  35.29 
 
 		 123 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  32.03 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  32.04 
 
 		 122 aa  45.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  34.65 
 
 		 123 aa  45.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  32.04 
 
 		 122 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 122 aa  45.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  34.45 
 
 		 123 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  36.94 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  37.27 
 
 		 120 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  34.62 
 
 		 122 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  33.62 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  37.5 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  27.72 
 
 		 122 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  28.71 
 
 		 122 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  27.72 
 
 		 122 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  32 
 
 		 124 aa  41.6  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>