54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2234 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 175 aa  357  6e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  71.26 
 
 		 175 aa  256  9e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  67.24 
 
 		 174 aa  242  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  66.09 
 
 		 175 aa  230  8.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  66.67 
 
 		 174 aa  227  7e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  53.14 
 
 		 174 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  51.43 
 
 		 173 aa  191  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  61.84 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  57.89 
 
 		 205 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  56.58 
 
 		 205 aa  185  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  57.24 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  53.95 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  51.55 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  49.72 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  53.29 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  55.33 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  52.63 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  53.29 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  54.61 
 
 		 194 aa  164  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  52.63 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  56.29 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  51.32 
 
 		 193 aa  160  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  51.32 
 
 		 193 aa  160  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  50 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  51.97 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  49.67 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  47.37 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  40.59 
 
 		 301 aa  117  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  38.83 
 
 		 305 aa  115  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.68 
 
 		 300 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.68 
 
 		 300 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  38.66 
 
 		 304 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  37.65 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  37.13 
 
 		 297 aa  102  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  34.17 
 
 		 119 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  33.62 
 
 		 120 aa  47.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  35.96 
 
 		 124 aa  47.8  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  34.15 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  36.44 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  33.61 
 
 		 120 aa  45.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  30.17 
 
 		 123 aa  44.3  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  36.97 
 
 		 120 aa  44.3  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  35.54 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0975  50S ribosomal protein L18  43.06 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000749489  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  35 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  32.79 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  32.76 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0437  50S ribosomal protein L18  39.74 
 
 		 116 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0352057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  32.5 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  35.59 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  32.76 
 
 		 120 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  31.31 
 
 		 123 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  30.93 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0735  ribosomal protein L18  35.71 
 
 		 115 aa  40.8  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0002396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>