34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1759 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  65.8 
 
 		 195 aa  277  6e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  56.92 
 
 		 196 aa  228  6e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  60.42 
 
 		 205 aa  227  7e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  57.29 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  58.25 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  53.12 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  53.12 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  48.44 
 
 		 193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  48.44 
 
 		 193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  47.92 
 
 		 193 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  47.4 
 
 		 193 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  47.94 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  46.81 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  44.79 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  44.27 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  44.79 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  52.83 
 
 		 165 aa  155  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  43.52 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  50.32 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  47.85 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  49.67 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  47.71 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  48.37 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  47.44 
 
 		 174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  43.51 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  41.18 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  32.91 
 
 		 304 aa  105  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  43.17 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.9 
 
 		 300 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.9 
 
 		 300 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  29.8 
 
 		 305 aa  94.4  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  28.99 
 
 		 301 aa  87.8  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  30.92 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>