105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1847 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  84.78 
 
 		 187 aa  320  6e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  82.42 
 
 		 182 aa  312  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  82.97 
 
 		 182 aa  313  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  77.3 
 
 		 185 aa  293  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  50.51 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  47.96 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  51.83 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  50.26 
 
 		 193 aa  191  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  50.26 
 
 		 193 aa  191  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  50.51 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  49.21 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  50.28 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  49.21 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  53.95 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  52.2 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  45.88 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  52.94 
 
 		 174 aa  174  8e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  46.41 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  46.88 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  44.85 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  46.81 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  49.06 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  47.17 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  48.39 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  42.35 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  44.75 
 
 		 169 aa  141  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  33.61 
 
 		 305 aa  106  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  33.5 
 
 		 297 aa  101  8e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  35.21 
 
 		 160 aa  94.7  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  32.02 
 
 		 301 aa  94.4  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.66 
 
 		 300 aa  93.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.66 
 
 		 300 aa  93.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  32.34 
 
 		 304 aa  89.4  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  34.17 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  37.62 
 
 		 122 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  38.38 
 
 		 122 aa  52.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  37.62 
 
 		 122 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  36.07 
 
 		 119 aa  51.2  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  30.58 
 
 		 122 aa  51.2  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  31.67 
 
 		 120 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  35 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  31.4 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  38.02 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  35.83 
 
 		 119 aa  47.8  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  35.83 
 
 		 119 aa  47.8  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  31.58 
 
 		 122 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  30 
 
 		 120 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  34.91 
 
 		 120 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  34.48 
 
 		 120 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  32.46 
 
 		 122 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  34.35 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  30.33 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  37.8 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  30.33 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  37.19 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  37.8 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  37.4 
 
 		 122 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  36.59 
 
 		 120 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  29.46 
 
 		 122 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  29.46 
 
 		 122 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06410  50S ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 116 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00978537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  37.63 
 
 		 120 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  36 
 
 		 122 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  30 
 
 		 120 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  30.7 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  37.4 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  33.06 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  32.8 
 
 		 122 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  30.33 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  39 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0076  50S ribosomal protein L18  32.43 
 
 		 117 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0482673  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  34.09 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  32.79 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  32.79 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0491  50S ribosomal protein L18  30 
 
 		 121 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0842  50S ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 117 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  32.77 
 
 		 120 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  35.25 
 
 		 127 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  33.9 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  33.9 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  33.9 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  33.9 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  33.9 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  31.53 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  33.9 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  33.9 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0617  ribosomal protein L18  31 
 
 		 117 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0437  50S ribosomal protein L18  34.18 
 
 		 116 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0352057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0617  50S ribosomal protein L18  27.59 
 
 		 121 aa  42  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  33.9 
 
 		 120 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  31.97 
 
 		 136 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  35.04 
 
 		 118 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  33.9 
 
 		 120 aa  41.6  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  36.36 
 
 		 123 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0410  50S ribosomal protein L18  30.39 
 
 		 119 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0385  50S ribosomal protein L18  30.39 
 
 		 119 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>