34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0398 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 160 aa  328  3e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  48.3 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  43.36 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  44.44 
 
 		 207 aa  116  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  39.1 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  45.45 
 
 		 205 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  41.83 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  41.83 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  43.36 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  43.36 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  40.52 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  41.26 
 
 		 205 aa  110  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  41.78 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  41.61 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  37.65 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  42.48 
 
 		 194 aa  108  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  41.5 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  42.96 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  37.32 
 
 		 187 aa  103  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  38.03 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  38.03 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  37.06 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  43.17 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  36.05 
 
 		 185 aa  101  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  41.73 
 
 		 195 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  38.93 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  35.21 
 
 		 186 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  33.33 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  27.17 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  27.65 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  27.65 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  27.93 
 
 		 301 aa  51.2  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  27.16 
 
 		 304 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  25.58 
 
 		 297 aa  43.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>