57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0461 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  74.14 
 
 		 175 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  71.26 
 
 		 174 aa  257  7e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  71.26 
 
 		 175 aa  256  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  64.37 
 
 		 174 aa  223  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  56.58 
 
 		 205 aa  184  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  50.29 
 
 		 174 aa  184  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  48 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  57.24 
 
 		 205 aa  180  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  55.26 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  53.95 
 
 		 205 aa  177  7e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  52.9 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  46.15 
 
 		 182 aa  167  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  51.32 
 
 		 182 aa  164  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  55.26 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  47.17 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  53.29 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  50.66 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  50.66 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  52.05 
 
 		 169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  51.97 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  44.26 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  49.34 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  54.36 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  48.03 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  47.71 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  44.08 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  43.36 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  38.24 
 
 		 301 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  35.6 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.24 
 
 		 300 aa  106  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40.24 
 
 		 300 aa  106  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  33.18 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  36.31 
 
 		 304 aa  99.8  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  38.38 
 
 		 124 aa  50.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  38.78 
 
 		 123 aa  50.8  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  38.38 
 
 		 123 aa  50.4  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  32.77 
 
 		 120 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  33.61 
 
 		 120 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  37 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  38.61 
 
 		 121 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  33 
 
 		 119 aa  45.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  36 
 
 		 127 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  32.77 
 
 		 123 aa  44.7  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  36.54 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  35.71 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  35.35 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  35.35 
 
 		 128 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  36.63 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  35.35 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  33 
 
 		 120 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  33.33 
 
 		 123 aa  41.2  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0410  50S ribosomal protein L18  32.04 
 
 		 119 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0385  50S ribosomal protein L18  32.04 
 
 		 119 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  35.64 
 
 		 120 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>