49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0663 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1255  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0510515  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0663  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.745835  hitchhiker  0.00718552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0160  50S ribosomal protein L18P  96.89 
 
 		 193 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000106085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0729  50S ribosomal protein L18P  92.23 
 
 		 193 aa  358  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.527877  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1403  50S ribosomal protein L18P  74.23 
 
 		 194 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1868  50S ribosomal protein L18P  54.17 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.607425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0173  50S ribosomal protein L18P  54.17 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1254  50S ribosomal protein L18P  51.56 
 
 		 205 aa  208  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.343178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2006  50S ribosomal protein L18P  52.88 
 
 		 205 aa  208  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0010  50S ribosomal protein L18P  51.3 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0479899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0237  50S ribosomal protein L18P  51.83 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1847  50S ribosomal protein L18P  50.26 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2311  50S ribosomal protein L18P  47.64 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0229  ribosomal protein L18P/L5E  49.74 
 
 		 182 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2237  ribosomal protein L18P/L5E  49.21 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1759  ribosomal protein L18P/L5E  48.44 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0583  50S ribosomal protein L18P  53.29 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0350633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0110  50S ribosomal protein L18P  45.55 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000173795  unclonable  0.000000375712 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0100  50S ribosomal protein L18P  49.43 
 
 		 174 aa  167  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.797471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2430  50S ribosomal protein L18P  47.37 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1502  ribosomal protein L18P/L5E  50.31 
 
 		 165 aa  165  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000114227  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0551  50S ribosomal protein L18P  51.63 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491439  normal  0.444285 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0020  50S ribosomal protein L18P  43.98 
 
 		 173 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000151629  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0461  50S ribosomal protein L18P  50.66 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2234  50S ribosomal protein L18P  51.32 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00761601  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0091  50S ribosomal protein L18P  42.93 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000239035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1709  50S ribosomal protein L18P  45.26 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0341249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0398  50S ribosomal protein L18P  41.83 
 
 		 160 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0260664 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05360  60s ribosomal protein l5-b, putative  34.89 
 
 		 304 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76097  predicted protein  35.05 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27400  Ribosomal protein L5A, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.05 
 
 		 300 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.105489 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51384  Ribosomal protein L5B, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.05 
 
 		 300 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499085 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31919  predicted protein  33.33 
 
 		 305 aa  102  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01013  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L5 (Broad)  32.47 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376622  normal  0.567036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  34.12 
 
 		 120 aa  48.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  34.18 
 
 		 122 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  36 
 
 		 122 aa  45.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  37.86 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  36.84 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  39.77 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  36.45 
 
 		 120 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  36.19 
 
 		 120 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  32.29 
 
 		 122 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  32.29 
 
 		 122 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  31.31 
 
 		 121 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  31.31 
 
 		 122 aa  42.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  31.65 
 
 		 122 aa  41.6  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  30.38 
 
 		 122 aa  41.6  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  31.08 
 
 		 114 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>